Проблема с водным налогом для ГЭС угрожающе маячит уже давно. В соответствии с перспективами реформирования и переходом к либерализованному рынку до сих пор так и не решен вопрос насчет дальнейших тарифов ГЭС. Если отпустить тарифы ГЭС в «свободное плавание», то последние вырастут в 5-8 раз, достигнув среднеотраслевого уровня. Тогда ГЭС /в составе гидроОГК/ окажутся вне конкуренции, получив существенно большую рентабельность в сравнении с тепловыми станциями за счет в разы более низкой себестоимости. Поэтому в правительстве звучали варианты сохранения госконтроля над тарифами в ближайшей перспективе, либо повышение водного налога для снижения рентабельности ГЭС при «свободных» тарифах. Поступления от водного налога предлагается направлять на инвестиции в отрасль. В настоящий момент увеличение ставок водного налога с 2005 г., при регулируемых тарифах, негативно для ГЭС, которые в настоящий момент не блещут высокой рентабельностью, негативно для них. Поэтому вероятнее всего энергетики будут лоббировать повышение и без того оптовых тарифов ГЭС. В противном случае это грозит снижением рентабельности гидроэлектростанций.”