После окончания Московского финансового института в 1955 г А.Войлуков в течение 20 лет работал в Красноярском управлении Госбанка СССР, пройдя путь от инспектора планово-экономического отдела до заместителя управляющего Красноярской краевой конторой Госбанка СССР.
В 1976-1979 гг А.Войлуков работал в должностях заместителя начальника управления денежного обращения Госбанка СССР, советника по банковским вопросам в Афганистане, начальника управления денежного обращения Госбанка СССР. В 1990-1991 г А.Войлуков занимал пост заместителя председателя правления Госбанка СССР.
С 1992 г А.Войлуков бессменно работал на посту первого заместителя председателя Банка России и члена совета директоров Банка России. А.Войлуков является признанным авторитетом в сфере организации наличного денежного обращения и эмиссионно-кассовой работы, курировал прежде всего эти направления работы ЦБ РФ.
Работу в должностях первых заместителей председателя Банка России продолжают Андрей Козлов, Алексей Улюкаев и Татьяна Парамонова.