Ассамблея создана в связи с необходимостью более тесного межпарламентского сотрудничества в целях реализации положений, изложенных в Совместной декларации Республики Абхазия, Приднестровской Молдавской Республики, Республики Южная Осетия от 14 июня 2006 года, отмечается в подписанном документе.
МПА является консультативным институтом для обсуждения вопросов и рассмотрения проектов документов, представляющих общий интерес и формируется из парламентских делегаций сторон, передает ИТАР-ТАСС.
Межпарламентская Ассамблея для осуществления своих полномочий создает рабочие органы и Секретариат, возглавляемый Генеральным секретарем.
Функции председательствующего на пленарном заседании Межпарламентской Ассамблеи осуществляют поочередно руководители законодательных органов сторон.