В ноябре 2007 года Банком "Электроника" было предоставлено 10 гарантий таможенным органам на общую сумму 20,5 млн. рублей. Большая часть гарантий была предоставлена для ООО "Фирма ОКВ" - одного из крупнейших импортеров высококачественных алкогольных напитков из Европы и Северной Африки.
С 20 января 2003 года Банк "Электроника" включен в реестр банков, имеющих право выступать в качестве гаранта перед таможенными органами. Банк активно работает в этом направлении, предоставляя данную услугу своим клиентам. Использование таможенных гарантий позволяет осуществлять внешнеэкономическую деятельность с отсрочкой оплаты таможенных пошлин, что экономит средства, поскольку внесенные таможенные платежи возврату не подлежат.
Максимально допустимая сумма одного гарантийного обязательства банка – 35 млн. рублей. Максимальная сумма всех гарантийных обязательств АКБ "Электроника" ОАО перед ГТК РФ составляет 170 млн. рублей.