Совместный контроль предполагается осуществлять посредством обмена информацией о лицах, транспортных средствах, грузах, товарах и животных, пересекающих и перемещаемых через границу, о результатах контроля, а также признания на основе взаимности применяемых сторонами средств идентификации, документов, используемых для целей контроля.
Осуществление совместного контроля на российско-казахстанской границе предусмотрено планом по переносу согласованных видов государственного контроля на внешнюю границу Таможенного союза, утвержденным решением Комиссии Таможенного союза ЕврАзЭС.