Прения начнутся выступлениями гособвинителей, которые дадут оценку исследованным в ходе судебного следствия доказательствам, выскажут свою точку зрения на степень доказанности обвинения, а затем предложат срок наказания, который считают справедливым для подсудимых. Затем будет предоставлена возможность выступить представителям потерпевших и гражданских истцов. В числе потерпевших по уголовному делу признаны компании "Роснефть" (ROSN), "Самаранефтегаз" и "Томскнефть", Федеральное агентство по управлению госимуществом, а также ряд бывших акционеров дочерних компаний "ЮКОСа". Еще на стадии следствия они заявили иски в общей сложности на 170 млрд руб.
Во второй части прений слово будет предоставлено подсудимым и их защитникам. Не исключено, что прения займут не один день, поскольку судья не вправе ограничивать продолжительность данной стадии процесса, хотя может остановить кого-либо из выступающих, если посчитает, что они касаются обстоятельств, не имеющих отношения к рассматриваемому уголовному делу, а также доказательств, признанных недопустимыми.
После прений гособвинение, потерпевшие, подсудимые и их адвокаты вправе по одному разу выступить с репликой. Право последней реплики принадлежит стороне защиты. После прений подсудимым дадут выступить с последним словом, после чего судья удалится в совещательную комнату для вынесения приговора, предварительно назначив дату его оглашения.
Второе уголовное дело в отношении бывших руководителей "ЮКОСа" и МЕНАТЕП слушается председателем Хамовнического суда Виктором Данилкиным, со стороны обвинения в процессе принимают участие 5 прокуроров. Интересы подсудимых в ходе процесса представляли около 10 адвокатов.
Судебный процесс в Хамовническом суде Москвы начался 3 марта 2009 г, за 19 месяцев прошло около 280 заседаний. За это время суд изучил 188 томов материалов уголовного дела, а также многочисленные документы, в том числе протоколы собраний акционеров, решения арбитражных судов, постановления о выемках документов, договоры обмена акций. В суде выступили 81 свидетель: 52 - со стороны обвинения и 29 свидетелей защиты. В частности, суд допросил главу Сбербанка России (SBER) Германа Грефа и министра промышленности и торговли РФ Виктора Христенко. При этом в список обвинительно заключения в качестве свидетелей были включены 250 человек, а защита настаивала на вызове еще 300 свидетелей.
Это второе уголовное дело в отношении М.Ходорковского и П.Лебедева. В мае 2005 г они были признаны Мещанским судом Москвы виновными по семи статьям УК РФ и осуждены к 9 годам, но в сентябре Мосгорсуд сократил им срок наказания до 8 лет. С учетом того, что срок заключения высчитывается с момента заключения под стражу, срок заключения истекает у П.Лебедева в июле 2011 г, у М.Ходорковского почти ровно через год - в октябре 2011 г. После вступления в силу первого приговора П.Лебедев был направлен в колонию в поселке Харп Ямало-Ненецкого автономного округа, М.Ходорковский - в Читинскую область.
Но в 2007 г им было предъявлено новое обвинение. Расследование второго дела было направлено в суд в феврале 2009 г, тогда же обвиняемые были вновь этапированы в Москву.
По новому уголовному делу они обвиняются в хищении чужого имущества в крупном и особо крупном размерах с использованием служебного положения. По версии следствия, обвиняемые в составе организованной группы в 1998-2003 гг совершили хищение путем присвоения крупных объемов нефти дочерних нефтедобывающих акционерных обществ НК "ЮКОС", "Самаранефтегаз", "Юганскнефтегаз" и "Томскнефть" ВНК на сумму более 892 млрд руб. Также они обвиняются в легализации денежных средств в крупном размере, полученных от продажи похищенной нефти на общую сумму, превышающую 487 млрд руб и 7,5 млрд долл. В 2008 г адвокат М.Ходорковского Юрий Шмидт, отвечая на вопросы журналистов, сказал, что по действующему уголовному законодательству в случае нового обвинительного приговора М.Ходорковскому и П.Лебедеву может грозить до 22,5 лет лишения свободы.
Прения по первому уголовному делу продолжались около двух недель. Новое дело более масштабно по числу материалов. В настоящее время срок содержания под стражей обвиняемых продлен до 17 ноября.