Субсидия предоставляется на содержание компании и обеспечение ее деятельности, а также на компенсацию расходов, связанных с уплатой арендной платы за земельные участки компании, финансовое обеспечение проведения кадастровых работ в отношении автомобильных дорог компании и земельных участков компании.
Субсидия предоставляется в пределах бюджетных ассигнований, предусмотренных в федеральном законе о федеральном бюджете на соответствующий финансовый год и плановый период, и лимитов бюджетных обязательств, утвержденных в установленном порядке Министерству транспорта РФ на указанные цели.
Для получения субсидии компания "Автодор" заключает с Министерством транспорта РФ договор о предоставлении субсидии, в котором предусматриваются: график предоставления субсидии; сроки и форма представления отчетности об использовании субсидии; право Министерства транспорта РФ на проведение проверок соблюдения компанией условий, установленных договором и данными правилами; ответственность сторон за нарушение условий договора.
Перечисление субсидии осуществляется ежеквартально в установленном порядке на счет территориального органа Федерального казначейства по месту открытия компанией лицевого счета.
Министерство транспорта РФ учитывает размеры и сроки предоставления субсидии при формировании прогноза кассовых выплат из федерального бюджета, необходимого для составления в установленном порядке кассового плана исполнения федерального бюджета.
Контроль за целевым использованием субсидии осуществляют Министерство транспорта РФ и Федеральная служба финансово-бюджетного надзора.