Судья планировал начать оглашение приговора еще 15 декабря, однако в этот день на двери суда появилось сообщение о том, что начало чтения переносится. Официальную причину тогда никто не назвал. В 2005 г аналогичным способом была перенесена дата оглашения первого приговора в отношении М.Ходорковского и П.Лебедева в Мещанском суде Москвы.
Согласно законодательству, приговор состоит из вводной, описательно-мотивировочной и резолютивной частей. Как правило, уже после вводной части становится понятно, посчитал ли суд доказанной вину подсудимых или приговор будет оправдательным. Затем суд оглашает мотивировочную часть, где описывается инкриминируемое преступление, доказательства, на которых основаны выводы суда, и мотивы, по которым были отвергнуты другие доказательства, а также анализ показаний свидетелей и обвиняемых. Наказание, которое суд назначает в случае признания вины, называется в конце приговора - в резолютивной части.
Оглашение приговора может занять длительное время. В частности, первый приговор М.Ходорковскому коллегия из трех судей читала более двух недель, при этом новое дело масштабнее по числу материалов и его рассмотрение заняло более длительное время. Таким образом, срок наказания, назначенный судом в случае признания вины, будет известен уже после новогодних праздников.
Второе уголовное дело в отношении бывших руководителей "ЮКОСа" и МЕНАТЕП слушается председателем Хамовнического суда Виктором Данилкиным, со стороны обвинения в процессе принимает участие четыре прокурора. Интересы подсудимых в ходе процесса представляли около 10 адвокатов.
В ходе прений сторон представители прокуратуры заявили, что считаю доказанной вину М.Ходорковского и П.Лебедева во всех инкриминируемых преступлениях, несмотря на то, что они не признали свою вину. При этом обвинение снизило изначально инкриминируемый объем хищения с 350 млн до 218 млн т нефти. Кроме того, обвинение считает, что подсудимые легализовали 487 млрд руб и 7,5 млрд долл, полученных от хищения. Прокуроры предложили квалифицировать действия подсудимых с учетом президентских поправок в Уголовный кодекс, которые смягчают ответственность по экономическим преступлениям. В то же время обвинение попросило освободить М.Ходорковского и П.Лебедева от наказания за хищение акций Восточной нефтяной компании/ВНК/ из-за истечения сроков давности, хотя настаивало на том, что их виновность доказана. Прокуратура потребовала назначить каждому из подсудимых наказание в виде 14 лет лишения свободы в колонии общего режима.
В свою очередь, М.Ходорковский просил вынести оправдательный приговор, заявив, что их невиновность вытекает непосредственно из обвинительного заключения и показания свидетелей.
Судебный процесс в Хамовническом суде Москвы начался 3 марта 2009 г, за 19 месяцев прошло около 280 заседаний. За это время суд изучил 188 томов материалов уголовного дела, а также многочисленные документы, в том числе протоколы собраний акционеров, решения арбитражных судов, постановления о выемках документов, договоры обмена акций. В суде выступил 81 свидетель: 52 - со стороны обвинения и 29 свидетелей защиты. В частности, суд допросил главу Сбербанка России (SBER) Германа Грефа и министра промышленности и торговли РФ Виктора Христенко. При этом в список обвинительно заключения в качестве свидетелей были включены 250 человек, а защита настаивала на вызове еще 300 свидетелей.
Это второе уголовное дело в отношении М.Ходорковского и П.Лебедева. В мае 2005 г они были признаны Мещанским судом Москвы виновными по семи статьям УК РФ и осуждены к 9 годам лишения свободы, но в сентябре Мосгорсуд сократил им срок наказания до 8 лет. С учетом того, что срок заключения высчитывается с момента заключения под стражу, срок заключения истекает у П.Лебедева в июле 2011 г, у М.Ходорковского - в октябре 2011 г. После вступления в силу первого приговора П.Лебедев был направлен в колонию в поселке Харп Ямало-Ненецкого автономного округа, М.Ходорковский - в Читинскую область. Но в 2007 г им было предъявлено новое обвинение. Расследование второго дела было направлено в суд в феврале 2009 г, тогда же обвиняемые были вновь этапированы в Москву.
По новому уголовному делу они обвиняются в хищении чужого имущества в крупном и особо крупном размерах с использованием служебного положения. По версии следствия, обвиняемые в составе организованной группы в 1998-2003 гг совершили хищение путем присвоения крупных объемов нефти дочерних нефтедобывающих акционерных обществ НК "ЮКОС", "Самаранефтегаз", "Юганскнефтегаз" и "Томскнефть" ВНК на сумму более 892 млрд руб. Также они обвиняются в легализации денежных средств в крупном размере, полученных от продажи похищенной нефти на общую сумму, превышающую 487 млрд руб и 7,5 млрд долл. В 2008 г адвокат М.Ходорковского Юрий Шмидт, отвечая на вопросы журналистов, сказал, что по действующему уголовному законодательству в случае нового обвинительного приговора М.Ходорковскому и П.Лебедеву может грозить до 22,5 лет лишения свободы.
