Согласно указу президента РФ, Федеральное агентство по рыболовству преобразовано в Государственный комитет РФ по рыболовству.
Госкомитету переданы функции Министерства сельского хозяйства РФ в сфере рыболовства, производственной деятельности на судах рыбопромыслового флота, изучения, сохранения, воспроизводства и использования водных биологических ресурсов, а также функции Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору в сфере контроля и надзора за водными биологическими ресурсами и средой их обитания.
За госкомитетом сохранены функции по оказанию государственных услуг, управлению государственным имуществом в сфере рыбохозяйственной деятельности и иные функции преобразуемого Федерального агентства по рыболовству.