За период с января 2009 по июнь 2011 года в результате «входного контроля» прямые убытки шести крупнейших российских компаний, занимающихся оптовой торговлей лекарственными средствами (СИА ИНТЕРНЕЙШНЛ, АПТЕКА-ХОЛДИНГ, РОСТА, Катрен, ПРОТЕК и Биотэк), составили 12,3 млн. руб., включая убытки от потери лекарственных препаратов, переданных на контроль.
Нарушение антимонопольного законодательства Управлением Росздравнадзора по Республике Башкортостан выразилось в согласовании Положения о Центре мониторинга безопасности лекарственных средств в Республике Башкортостан, что противоречит закону об обращении лекарственных средств и нарушает закон о защите конкуренции, поскольку наделяет хозяйствующий субъект функциями и правами органов контроля и надзора.
Соответствующие решение и предписание Комиссии ФАС России направлены на отмену незаконной процедуры входного контроля на территории Республики Башкортостан. Справочно
В период с 21 сентября по 18 ноября 2011 года ФАС России третий раз вынесла решение о незаконности повторного входного контроля качества лекарственных средств, проводимого в субъектах Российской Федерации. Предыдущими решениями нарушителями антимонопольного законодательства признаны Минздрав Свердловской области и Минздравсоцразвития Самарской области. В настоящее время ФАС России осуществляет сбор доказательной базы для возбуждения дел по входному контролю в Пермском крае, Республике Мордовия, Республике Бурятия, Кемеровской, Кировской, Нижегородской, Псковской, Смоленской, Челябинской и Оренбургской областях.
