Не согласившись с решением и предписаниями ФАС России, Правительство, Министерство и Фонд обратились в Арбитражный суд г. Москвы с требованием признать их незаконными и отменить.
В свою очередь суд, изучив фактические обстоятельства и материалы дела, поддержал позицию ФАС России о недопустимости создания для негосударственных медицинских учреждений дискриминационных условий в участии на рынке медицинских услуг в системе обязательного медицинского страхования.