Функции госзаказчика-координатора программы возложены на департамент жилищно-коммунального хозяйства и благоустройства Москвы. Персональным руководителем программы назначен руководитель департамента жилищно-коммунального хозяйства и благоустройства Москвы Андрей Цыбин.
Госзаказчиками программы также стали департамент городского заказа капитального строительства Москвы, департамент науки и промышленной политики Москвы, департамент образования Москвы.
Госзаказчику-координатору программы поручено ежегодно представлять в департамент экономической политики и развития города Москвы краткий сводный отчет о ходе выполнения мероприятий программы и предложения по корректировке целевых показателей 1 марта - за отчетный год, 15 ноября - за 9 месяцев текущего года и об ожидаемом выполнении за год.